Voor een aantal beleidsterreinen zijn speciale commissies actief. De commissies fungeren als platform voor de leden en adviseren het GAU-bestuur. Ook een aantal uitgeversgroepen heeft eigen werkgroepen die specifieke activiteiten organiseren.
Binnen de GAU zijn de volgende commissies en werkgroepen actief:
- Commissie Auteursrecht
- Distributiecommissie
- Marketingcommissie
- Werkgroep E-publishing/Titelinformatie
- Werkgroep Literaire Uitgeversgroep (LUG)
- Werkgroep Non-fictie
- Werkgroep Kinderboekenuitgevers (WKU)